其他恶意的破坏，即使不借助病毒或者其他的工具，只要拥有足够的权限，任何系统都有一定的“自毁”能力。比如依靠系统正常的删除、移动、格式化等操作也可以达到破坏数据的目的。随着网络技术的发展，威胁已经不仅于本机。

操作系统或应用软件的错误：随着操作系统和应用程序的代码量的成倍增加，BUG也在不断增加。我们常用的桌面系统WIN9X就是一个BUG大王。操作系统和应用软件的错误，往往会给人的工作带来一些不可预期的影响。比如前阶段，发现FRONTPAGE98的一个BUG，触发后会把你目录下的文件全部删除，另外，象的游戏神话II，出现了如不安装在默认目录中可能会使你丢失扩展分区这样严重的问题。

FDISK：FDISK当然是个危险的命令，很多人非常恐惧，事实上，FDISK命令的运行并不影响任何分区内的硬盘数据，他对分区的设置操作，只改变主分区表的数据区。而特别是FDISK异常重要的隐含参数/MBR，可以重建主分区表的代码区，清除主引导型病毒等。这是非常有用的操作。DOS6.22以下的系统，FDISK.EXE在DOS目录下，WIN9X系统中它在WINDOWSCOMMAND目录下，它也出现在WIN9X所生成的应急盘中。

FORMAT：在一些人眼中，FORMAT是可怕的命令，但他并不是对硬盘清零，特别值得注意的是，很多文件恢复工具都建议你恢复前先FORMAT该分区起到保护的饿作用。DOS6.22以下的系统，在DOS目录下，WIN9X系统中它在WINDOWSCOMMAND目录下，它也出现在WIN9X所生成的应急盘中。

HD-COPY：传统的软盘COPY工具，2.0版本以后加入了强制读的功能，可以读出一些损坏扇区的内容。

SYS：SYS命令是重建BOOT区的简洁的手段，也可以杀除BOOT区病毒。DOS6.22以下的系统，在DOS目录下，WIN9X系统中它在WINDOWSCOMMAND目录下，它也出现在WIN9X所生成的应急盘中。