灌装产品的无菌
食品物料的分为热力和冷。目前主要以热力为主，其又分和高温短时两种，物料的冷方法主要指紫外线和微波。简单解释如下：
（1）是指在温度和时间分别为135-150℃和2-8秒的条件下，对乳品或其他饮料进行处理的一种工艺。
（2）对有蒸煮味的物料可采用高温短时，在温度为70-75℃和时间为15-20s的条件下进行处理。
（3）冷方法是指采用紫外线、辐射、微波照射等以达到目的。
灌装环境的无菌
（1）无菌灌装环境首先要确保的是设备无菌，主要方法有加热法和化学法。
（2）对敞开式无菌灌装机而言，在无菌充填之前，灌装机内与产品接触的表面经过。其是通过灌装机自身产生的无菌热空气（或无菌热蒸汽）来实现的。在过程中，无菌热空气直接接触灌装机与产品接触的表面进行。
（3）封闭式无菌灌装机的只通过无菌热空气是不够的，还要保证封闭空间的无菌，即无菌室的。
（4）生产前，无菌室一般用双氧水喷雾和无菌空气的干燥来实现，无菌空气是通过灌装机内的无菌空气加热器将其加热至一定温度所得到的。
（5）时，液态双氧水喷射至无菌热空气中并瞬时蒸发，这样无菌空气和双氧水气体的混合物进入无菌室进行，冷凝在内表面的双氧水通过无菌热空气进行干燥，从而完成无菌室的。
（6）作为环境的一般采用洗涤、加热、和紫外线照射等措施，对与饮料相接触的装置和整个容器表面进行处理，空间环境则多采用，整个灌装系统无菌状态的维持则靠进入无菌空气并使整个系统保持一定的正压，以阻止外部空气中微生物侵入。
（7）设备停机时微生物会繁殖，可能导致大量微生物不能充分杀死。因此设备在清洗后应尽量抽干，以便没有水或溶液残留。
根据工艺性质、人的动作的多少和强弱的不同，这个倍数是不同的，可以分为较低（劳动强度低或坐着操作，几乎很少起来活动）和较高（劳动强度比一般水平高或活动比较频繁）两类，分别为3倍和7倍于静止发尘量的数值，相应为3×105粒/（min人）和7×105粒/（min人）。
根据不同的情况，不同级别相邻房间的正压值约为5Pa-10Pa,让不同洁净度的各级房间维持梯次的压差，目的是当房间门处于关闭情况时，通过缝隙的气流流向是由无尘车间流向低级别无尘车间、由低级别无尘车间流向走廊和服务区，再流向室外。这样就可减少由室外向服务区域，服务区域向低级别无尘车间，低级别无尘车间向无尘车间传播空气中的悬浮污染物。