工程保函的优势：
1、开盘成本低，能限度减少施工企业的资金占用，
2、可靠性高，有银行、保险公司或担保企业为施工企业背书，承诺在承包方不履行合同约定的义务或承诺的事项时，会有这些机构向发包方赔付约定的款项。
税款保付反担保函：是指对在银行开户的加工贸易企业，银行可为该企业出具以中国银行为受益人的反担保函。加工贸易企业在开展加工贸易业务中为免向海关缴纳税款保证金，需委托中国银行出具以海关为受益人的税款保付保函。
另外保险本身存在一个索赔困难的问题，由于保证保险是可以移到二级市场进行主体交易，也就是在甲公司开具的保证保险，有可能需要到乙公司进行索赔流程，还有可能流出海外，目前在福建福州已经出具红头文件明令禁止保证保险代替保函使用。
保函一般都规定一个明确的有效期限。除非保函中有特别说明，保函的有效期指收到受益人索偿文件的后期限。有效期限一过，保证人的责任便解除了。